El Mausoleo de Khayrbak se estableció en 1502, mientras que la Mezquita se había establecido 18 años después. A pesar de haberse construido en el período de transición del mameluco al dominio otomano, el estilo de la decoración es puramente mameluco. La Mezquita-Mausoleo de Khayrbak fue establecida por Emir Khayrbak Melbay El-Mahmudy, quien fue el virrey de Alepo y uno de los emires prominentes de la época. Para cumplir con su excesiva ambición y su deseo de obtener más poder, conspiró con los otomanos contra Sultan al-Ghuri en su lucha contra ellos. Después de derrotar a los mamelucos en Marj Dabiq y ganar el gobierno de Egipto, los otomanos nombraron a Khayrbak como el primer virrey otomano de Egipto. Él controló sobre el Palacio de Alin Aq y lo renovó para ser su propio Palacio.

Este complejo es uno de los edificios más distinguidos dentro del distrito de El Darb El Ahmar. El minarete y la cúpula de la mezquita están ricamente decorados con corazones y hojas y la forma exterior de ellos es triangular. El minarete se encuentra al otro lado de la fachada. El Sabil-Kuttab está cerca de la entrada de la mezquita. La mezquita tiene una entrada distintiva, ya que se puede entrar a través de un corredor bellamente decorado. Hay pocos pasos en el lado derecho del corredor que conducen a la Mezquita. Al otro lado del corredor, aparece una puerta que conduce al Sabil. En la entrada de la mezquita aparece un grupo de asientos de piedra. Además, el umbral de la mezquita está hecho de piedras de un edificio faraónico. Los arcos de la mezquita se construyen directamente a través de las ventanas de la Qibla. En la pared del Qibla, hay una puerta que conduce al Palacio de Alin Aq. El mausoleo de la mezquita no está lujosamente decorado, pero se distingue por su altura.