La mezquita de El Ishaqi se ubica en la calle El Darb El Ahmar y se puede ver claramente desde la Ciudadela. Fue fundado por Seif El-Din Qijmas El-Ishaqi El-Zaheiry, quien fue uno de los hombres nobles importantes en los días del Sultán Qaytbay. Trabajó como maestro de caballos y fue durante algún tiempo responsable de los asuntos de peregrinación y, finalmente, como virrey de Siria. Murió en 1487 y fue enterrado en la tumba abovedada en el lado derecho de la nave Qibla. La mezquita tiene dos fachadas decoradas de forma notable e idéntica. Está construido en un terreno triangular, pero el diseñador logró superar este problema de una manera muy singular. El Sabil-Kuttab de esta mezquita está separado de la mezquita que se encuentra al otro lado de la calle y todavía se usa como escuela.

En esa área aparecen también las ventanas Mashrabiya, además de una cúpula y el Minarete que están diseñados de una manera que difiere del diseño común en ese momento. Hay algunas pequeñas tiendas que rodean la mezquita. Cerca de la mezquita hay otro Sabil que se distingue por sus ventanas lujosamente decoradas. El blasón del sultán Qijmas está bellamente tallado en las paredes de la mezquita. Hay un panel bellamente decorado con formas de hojas de mármol de colores armoniosos en la entrada. Junto a la entrada aparece un patio cuadrado y su techo está finamente dorado. En el lado izquierdo de la entrada aparece un pasaje que ayuda a iluminar y ventilar el lugar. El interior de la mezquita explica que es una de las mejores mezquitas ornamentadas en el reinado de Qaytbay, ya que tiene piedras talladas con gracia en las paredes y los hermosos techos de madera. El Mihrab de la mezquita de Qijmas El-Ishaqi tiene paneles arabescos bien trabajados. Las ventanas actuales de la mezquita están decoradas con vidrieras que se pueden agregar en el período otomano.