La mezquita de Yusuf Agha El Hin se encuentra en la intersección de Sharia Port Said y Sharia Mohammed Ali, a pocos metros del Museo Islámico. Fue construido por Yusuf Agha El-Hin, quien era un destacado mameluco Bey u oficial. Murió en 1646 y fue enterrado en su mausoleo en el pasillo norte de la mezquita. La característica más interesante de la mezquita es la mezcla entre los estilos de decoración mamelucos y otomanos. La mayor parte de la mezquita está diseñada en estilo mameluco, mientras que el minarete está diseñado en el estilo otomano. El plan interior de la mezquita consta de varios pasillos, el más ancho de los cuales es el noroeste. De especial interés en esta mezquita son las bonitas inscripciones en forma de flor que aparecen alrededor del techo y las vidrieras. El Mihrab de la mezquita parece ser agregado a la mezquita en un proceso posterior de restauración. Con el paso del tiempo, la mezquita fue sometida a una serie de cambios, incluida la destrucción del santuario abovedado original durante los trabajos de construcción de la Sharia Mohammed Ali. 

Además, en 1900 se agregó un hermoso Sabil-Kuttab a la esquina noroeste de la mezquita. Este Sabil-Kuttab está bellamente decorado con ablaq voussoirs, spandrels de mármol y hermosos nichos de estalactitas. Las ventanas del Sabil están adornadas con marcos de madera magníficamente tallados. También hay una Mashrabiya que se extiende a través de la logia. La belleza de las paredes de la mezquita se acentúa a través de las ventanas de Mashrabiya que aparecen en ella y se utilizan para iluminar el plano interior.